Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGHG1P01857 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms