Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFNB1P01574 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFNB1P01574 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms