Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APBA3O96018 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBA3O96018 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBA3O96018 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA3O96018 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms