Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX58O95786 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX58O95786 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX58O95786 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX58O95786 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX58O95786 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms