Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVILO95425 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVILO95425 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVILO95425 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms