Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNKO75909 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNKO75909 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNKO75909 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNKO75909 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNKO75909 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNKO75909 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNKO75909 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms