Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPFIA3O75145 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms