Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSPNO60542 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSPNO60542 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSPNO60542 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PSPNO60542 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PSPNO60542 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PSPNO60542 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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