Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME2P1O60361 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms