Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CREB3O43889 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB3O43889 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB3O43889 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms