Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO3O43524 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO3O43524 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms