Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBDO15205 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBDO15205 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBDO15205 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms