Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E9PCH4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
E9PCH4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E9PCH4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E9PCH4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E9PCH4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms