Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L12C9JPN9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP17L12C9JPN9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms