Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRDCB7Z8K6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms