Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms