Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3B2A6NCE7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms