Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PIPSLA2A3N6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms