Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms