Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AUP1Q9Y679 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms