Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms