Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD54L2Q9Y4B4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms