Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKP3Q9Y446 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms