Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms