Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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