Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMED7Q9Y3B3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms