Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERGIC3Q9Y282 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms