Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAPRE3Q9UPY8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms