Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD1BQ9UPS6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD1BQ9UPS6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms