Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM35Q9UPQ4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms