Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNIKQ9UKE5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms