Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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RABGEF1Q9UJ41 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1Q9UJ41 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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