Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNAL1Q9UBT7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms