Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCHIP1Q9P0W5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms