Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf78Q9NZ63 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms