Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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