Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDAP2Q9NXN4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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