Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms