Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms