Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOMER3Q9NSC5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms