Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLE4Q9NR33 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLE4Q9NR33 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms