Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms