Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSU72Q9NP77 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms