Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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LHX5Q9H2C1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHX5Q9H2C1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms