Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB1BQ9H0U4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms