Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms