Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHE41Q9C0J9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms