Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CIPCQ9C0C6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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