Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ROPN1BQ9BZX4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms