Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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